Bernhard Maurer schloss seine Studien als Cellist und Musikpädagoge in Bern, Berlin und Basel mit Master für Pädagogik, Peformance und Musikvermittlung, so wie Gymnasiallehrerdiplom ab. Einige Jahre war er im Berner Sinfonieorchester und als Assistent an der Schola Cantorum Basiliensis tätig.
Er war Mitbegründer und bis 2015 Co – Leiter des Barockensembles „Die Freitagsakademie“. 
Heute wirkt er als Lehrer für Cello an der Musikschule Köniz und für Barockcello am Konsi Bern, als freischaffender Musiker sowie als Dirigent und Leiter von pädagogisch-künstlerischen Musikprojekten (www.cellobass.ch) und Improvisatioskursen musicforpeople.ch. 2022 übernahm er die Leitung des Orchesters Rondo Wabra. 
Seine Filmaufnahmen der Cellosuiten von J.S. Bach in 6 romanischen Kirchen sind zu sehen auf www.bachsuiten.ch.